В первые месяцы войны Клавдия Ивановна Пудовкина была мобилизована в армию, стала солдатом. В августе 1941 г. она стала служить в госпитале, в Лысогорском районе, медсестрой. Здесь подлечивали раненых, которые опять отправлялись на фронт, чтобы бить ненавистного врага. Раненые просили, чтобы их лечили быстрей.
Когда кровопролитные бои шли на Волге, под Сталинградом, Клавдия Ивановна вместе с госпиталем отправилась к Волге. Вместе с госпитальным эшелоном двигалась она по дорогам войны. Не доезжая до станций Миллерово и Лиски, эшелон был разбомблен, было много убитых и раненых. Ехать по железной дороге дальше было невозможно, госпиталю транспорт предоставили местные жители, чтобы везти госпитальное имущество. Сами работники госпиталя — и врачи, и сестры, и санитары — шли пешком. В дни Сталинградской битвы госпиталь работал прямо под Сталинградом, в 20 км. Раненых принимали в страшной обстановке непрекращающихся бомбежек, без сна и отдыха. Но — выстояли. Какая непобедимая сила жила в советских людях! И тыл, и фронт жили одной лишь мыслью — уничтожить врага.
После Сталинграда госпиталь отправился вслед за фронтом. И вот уже советские войска освободили Украину. Госпиталь остановился в Луганске.
По воспоминаниям К.И. Пудовкиной
«Мы заняли под госпиталь 2-этажное здание, заполнили его ранеными и стали лечить. Вдруг прилетели фашистские самолеты и начали бомбить город. Ох, что тут было! Вся земля сотрясалась, рушились здания. Под такой страстью огня нам пришлось вытаскивать раненых в укрытия. Госпиталь рухнул, всех засыпало кирпичами». Смена Клавдии Ивановны находилась тогда в другом здании; они не так пострадали — были засыпаны осколками стекла и обвалившейся штукатуркой. Зенитчики тем временем отогнали фашистские самолеты, и медперсонал — кто остался в живых — стал откапывать раненых, оказывать им помощь.
К.И. Пудовкина закончила свой фронтовой путь в Австрии в 1945 г. В ноябре она была демобилизована и вернулась в Пугачёв. Награждена орденом Красной Звезды и тремя медалями: «За освобождение Праги», «За взятие Берлина» и «За победу над Германией»